湖南省健康猪群中不同基因型猪博卡病毒流行性及进化分析

来源：华北农学报杂志2017年第5期北京时间：

作者：屈泰龙, 李润成, 罗斌宇, 葛猛, 严美君, 胡辉灿, 余兴龙

单位：湖南农业大学 动物医学院, 湖南 长沙 410128

摘要：为了解猪博卡病毒在不同年龄健康猪群中的感染情况，通过对GenBank登录的猪博卡病毒基因序列分析设计2对引物可分别扩增PBoV1/2的部分NS1基因和PBoV3/4/5的部分VP1基因。提取2016年8-12月收集自湖南5个集约化猪场2~20周龄猪共430份肛门拭子样品的DNA并进行PCR检测。PBoV阳性率为64.6%（278/430），PBoV1/2阳性率为27.2%（117/430），PBoV3/4/5阳性率为45.1%（194/430），混合感染率为7.7%（33/430），PBoV3/4/5阳性率显著高于PBoV1/2阳性率（P=0.034）。PBoV1/2在2~10周检出率高于其他周龄，但是与其他周龄猪体内检出率统计分析无显著性差异，PBoV3/4/5主要感染8~16周猪，与4周以内猪差异显著，与其他猪群差异不显著。对各型的核苷酸与参考序列核苷酸相似性分析显示PBoV1/2之间的平均相似度为85.4%，PBoV3/4/5之间的平均相似度为67.2%。PBoV在健康猪群中流行广泛且存在共同感染现象，对猪的健康尤其是肠道微生物平衡可能存在潜在影响。

关键词：猪博卡病毒,流行性,进化分析,混合感染,致病性,

基金资助：湖南省战略性新兴产业科技攻关类项目（2016GK4015）