《华北农学报杂志》发表论文赏析

紫苏PfDGAT2基因生物信息学及表达特性分析

来源:华北农学报杂志2017年第5期北京时间:

作者:梁倩, 李璐, 周雅莉, 安茜, 王计平

单位:山西农业大学 农学院, 山西 太谷 030801

摘要:为研究二酯酰甘油酰基转移酶2(PfDGAT2)在紫苏种子油脂合成过程中的调控作用,对紫苏DGAT2基因及其编码的蛋白质进行了详细的生物信息学分析,并研究了该基因在不同紫苏品种中的表达特性。结果表明,PfDGAT2基因cDNA全长1 249 bp,共编码329个氨基酸;DGAT2蛋白的等电点为9.46,属于碱性蛋白质;二级结构预测表明,紫苏DGAT2蛋白的主要结构元件是无规则卷曲(34.65%)和α-螺旋(30.09%);系统进化树分析表明,紫苏与芝麻和烟草的亲缘关系较近,与油橄榄的亲缘关系较远。通过研究PfDGAT2基因在含油量不同的2个紫苏品种种子发育的不同时期表达特性,结果表明,该基因在开花后30 d形成的种子中表达量最高,但是二者又具有一定差异,晋紫苏1号(含油量46.88%)表达量为开花后10 d的1.63倍,并紫苏1号(含油量35.60%)为0.75倍,因此,推测DGAT2在紫苏TAG生物合成中起重要调控作用。

关键词:紫苏,二酯酰甘油酰基转移酶2(DGAT2),生物信息学,表达特性分析,

基金资助:国家自然科学基金项目(31201266);山西省晋中市科技重点研发计划(农业)项目(Y172007-5)

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