马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析

来源：华北农学报杂志2017年第5期北京时间：

作者：理向阳, 代丹丹, 杨铁钢, 郝西

单位：河南省农业科学院 经济作物研究所, 河南 郑州 450002

摘要：为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能，鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族，分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明，马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因，包括A（21）、B（5）、LA（1）和LB（6）4个亚家族，分布在马铃薯11条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度为194~488 aa，编码蛋白质具有保守的结构域，蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明，马铃薯扩展蛋白家族有23个基因（69.7%）含有2~3个内含子。基因表达分析发现，该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实及块茎发育过程中表达丰度较高，并且其表达受到高温、盐、激素及病害等逆境的调控。

关键词：马铃薯,扩展蛋白,生物信息学,基因家族,

基金资助：河南省农业科学院自主创新项目（2016ZZ20）