《华北农学报杂志》发表论文赏析

二穗短柄草谷氨酸类受体系统发生学和基因表达分析

来源:华北农学报杂志2017年第6期北京时间:

作者:刘洋, 安丹丹, 程宇来, 祁智, 亢燕

单位:1. 内蒙古和盛生态科技研究院有限公司, 内蒙古 呼和浩特 010010;;2. 内蒙古大学 生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010021

摘要:二穗短柄草基因组已被测序,与麦类作物和牧草近缘。二穗短柄草作为温带禾本科模式植物,有很多重要基因序列结构、进化信息等需要进一步挖掘。以拟南芥AtGLRs氨基酸序列为种子序列,利用Phytozome数据库中Blast工具,获得19个二穗短柄草谷氨酸受体候选序列。基于谷氨酸受体氨基酸序列构建系统发生树,结果显示,BdGLRs与AtGLRs聚类距离较近,亲缘关系较好。将20个AtGLRs和19个BdGLRs分别构建系统发生树,拓扑结构类似,均分为3枝,表明BdGLRs也有3个亚家族。参考AtGLRs的分类和命名规则,将BdGLRs分为3类,分别命名为BdGLR1.1-1.4、BdGLR2.1-2.10和BdGLR3.1-3.5。通过半定量和定量反转录PCR分析发现在三叶期,BdGLR家族各成员表达各异,相同成员在不同组织中表达不同,不同成员在相同组织表达不同。除BdGLR1.4和BdGLR2.6-2.10,其余BdGLRs在根、茎、叶中均有表达。为二穗短柄草的谷氨酸受体基因功能的深入研究提供线索,也为后续禾本科农作物和牧草遗传改良提供理论依据。

关键词:二穗短柄草,谷氨酸受体,系统发生树,半定量反转录PCR,

基金资助:内蒙古自治区科技重大专项(内财教[2014]2020号)

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