《华北农学报杂志》发表论文赏析
作者:张凯, 高珊, 朱树华
单位:山东农业大学 化学与材料科学学院, 山东 泰安 271018
摘要:为了深入研究己糖激酶(HK)的同工酶HK Ⅱ调控线粒体通透性转换孔(MPTP)的开放机理,通过RT-PCR技术和RACE技术,以克隆得到的肥城桃果实cDNA为模板,成功克隆得到HK Ⅱ基因全长,经原核表达和SDS-PAGE检测,体外构建原核表达载体pET-30a-HK Ⅱ ,成功地在大肠杆菌BL21(DE3)中进行表达;使用镍柱纯化法,得到纯化的重组蛋白。克隆得到HK Ⅱ基因共1 835 bp,其中编码区1 496 bp,共编码497个氨基酸。HK Ⅱ蛋白预测分子式为C2379H3846N652O717S17,原子总数为7 611个,分子量为53.6 kDa,理论等电点为6.17,总平均疏水指数为0.023,表明HK Ⅱ蛋白为疏水性蛋白。TMHMM跨膜结构预测HK Ⅱ为跨膜蛋白,有1次跨膜,绝大部分在膜外。从二级结构预测结果来看,HK Ⅱ蛋白由15段α螺旋和11段β折叠和无规则卷曲构成。肥城桃HK Ⅱ蛋白预测的三级结构呈V字型,折叠结构较多。系统进化树和氨基酸相似性分析发现,桃果实HK Ⅱ与枇杷的相似度最高,达到了96.98%,桃果实HK Ⅱ与其他植物HK的氨基酸的同源性较高,说明HK Ⅱ具有较高的保守性。为进一步解析HK Ⅱ蛋白的结构和功能从而探讨HK Ⅱ调控线粒体MPTP的机理奠定了基础。
关键词:肥城桃,己糖激酶,基因克隆,生物信息学分析,原核表达,
基金资助:国家自然科学基金项目(31270723)