水稻耐盐性QTL的meta分析及候选基因发掘

来源：华北农学报杂志2017年第6期北京时间：

作者：雷蕾, 郑洪亮, 杨洛淼, 赵宏伟, 王敬国, 刘化龙, 孙健, 邹德堂

单位：东北农业大学 水稻研究所, 黑龙江 哈尔滨 150030

摘要：为了获得真实有效的水稻耐盐性QTL信息，并缩小QTL的置信区间以及预测区间内的候选基因。以水稻6个遗传图谱的整合结果为公共图谱，并收集344个与水稻耐盐性相关的QTL。利用BioMercator V4.2，在图谱整合的基础上，对一致性QTL区间的注释基因进行生物信息学分析。结果表明：共检测到46个和水稻耐盐性相关的一致性QTL，对其中8个物理距离在0.5 Mb附近的一致性QTL区间进行了物理图谱定位和候选基因分析，共有1 489个预测基因被检测到，参与了细胞合成、催化活性、水解酶活性和新陈代谢等主要功能。对一致性QTL区间内已克隆的水稻耐盐基因进行蛋白序列分析后，发现9个候选基因同已知耐盐基因的保守结构域相似，分别为OS01G0813100、OS01G0869900、OS02G0753000、OS03G0282100、OS03G0607700、OS07G0150500、OS09G0369050、OS09G0434500和OS09G0522100。研究发现的遗传距离小于0.1 cM的Mqtl两端的标记可用于分子标记辅助育种，发掘的9个和水稻耐盐基因具有高度蛋白序列相似性的注释基因，可为水稻耐盐性基因的克隆和功能验证奠定基础。

关键词：水稻,耐盐性状,元分析,候选基因,

基金资助：国家自然科学基金项目（31601377）；黑龙江省重大科技招标基金项目（GA14B102-02）