《华北农学报杂志》发表论文赏析

高油酸油菜脂肪酸代谢的蛋白质组学与转录组学关联分析

来源:华北农学报杂志2017年第6期北京时间:

作者:王晓丹, 肖钢, 常涛, 张振乾, 官春云, 邬贤梦

单位:湖南农业大学 农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 湖南 长沙 410128

摘要:为了解高油酸油菜脂肪酸代谢的调控机理,以一组高油酸近等基因系自交授粉后20~35 d的种子为材料,进行同位素相对标记技术与绝对定量技术关联转录组分析。结果表明:蛋白质组和转录组相关性并不高,定量蛋白和基因关联系数为-0.326 9;变化趋势相反差异蛋白和基因的表达关联系数为-0.735 8;变化趋势相同差异蛋白和基因的表达关联系数为0.714 3。此外,鉴定出与差异蛋白表达趋势相同的差异基因80个,GO注释表明,这些基因涉及代谢、信号转导、防御与胁迫应答、氧化还原、转录等方面的功能,其中与脂肪酸代谢过程相关的有23个,上调表达16个,下调表达7个。gi|297330358(庚二酰ACP甲基酯的羧酸酯酶)、gi|297321940(磷酸化酶)、gi|297314818(乙酰胺、甲酰胺酶家族)可能在高油酸油菜脂肪酸代谢中发挥重要作用。证明蛋白质组学与转录组学关联分析能够对研究高油酸油菜脂肪酸代谢机制提供新思路。

关键词:蛋白质组学,转录组学,关联分析,高油酸油菜,脂肪酸代谢,

基金资助:国家“973”计划项目(2015CB150206);国家自然科学基金项目(31201240);湖南省科技重大专项(2014FJ1006);作物种质创新与资源利用国家重点实验室培育基地开放课题;湖南农业大学作物学开放基金项目(ZWKF201302)

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