《华北农学报杂志》发表论文赏析

氮素胁迫对水稻根系影响的转录组分析

来源:华北农学报杂志2018年第1期北京时间:

作者:邵彩虹, 李瑶, 钱银飞, 陈金, 陈先茂, 关贤交, 刘光荣, 彭春瑞, 邱才飞

单位:1. 江西省农业科学院 土壤肥料与资源环境研究所, 江西 南昌 330200;;2. 农业部长江中下游作物生理生态与耕作重点实验室, 江西 南昌 330200

摘要:养分胁迫会直接影响水稻的生长发育,相对于地上部分,根系往往较早感知环境胁迫。为了研究水稻根系对养分胁迫响应的分子机制,通过Illumina Hiseq2000平台测序,对氮素胁迫下水稻根系转录基因表达情况进行分析。结果表明,氮素胁迫诱导根系出现了2 270个差异转录基因,其中上调表达的有1 176个,下调表达的有1 094个。采用GO功能分类和Pathway功能注释,可将注释的基因划分为48个功能类别118条代谢途径,包括糖酵解、脂肪酸代谢、氧化磷酸化、氨基酸代谢、淀粉蔗糖代谢等生物学过程。部分根系关键基因表达变化表明,氮素胁迫诱导大量新生蛋白质合成,形成各种酶类,促进新RNA合成,从而形成了更多的新生蛋白质。氮素胁迫诱导根系IAA积累更多来自极性运输,参与植物细胞伸长发育的EGase基因及木质素特异合成途径的关键酶(CCR)表达量发生上调,这些转录基因表达量的变化是根系受养分胁迫刺激而发生了伸长生长的内在机制。

关键词:水稻,根系,氮素胁迫,转录组,

基金资助:国家重点研发计划项目(2016YFD030050702;2016YFD03001008);江西省农业科学院创新基金项目(2013CQN001);江西省自然科学基金项目(2015ZBAB214013)

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