五个地方绵羊种群mtDNA D-loop区系统进化及遗传多样性分析

来源：华北农学报杂志2018年第1期北京时间：

作者：梁瑞圆, 陈晓勇, 孙洪新, 孙少华, 敦伟涛, 沈志强, 刘军峰, 王珏

单位：1. 河北省畜牧兽医研究所, 河北 保定 071000;；2. 河北农业大学 动物科技学院, 河北 保定 071000;；3. 山东省滨州畜牧兽医研究院, 山东 滨州 256600

摘要：为探讨我国部分地方种群绵羊的起源进化及遗传多样性。对河北小尾寒羊、山东小尾寒羊、苏尼特羊、洼地绵羊、湖羊等5个地方绵羊种群mtDNA D-loop区全序列进行了测序和遗传变异分析，并利用生物信息学方法分析了种群间的亲缘关系以及母系起源。结果表明，5个绵羊种群mtDNA D-loop区序列共发现了135个多态位点，形成了108种单倍型。单倍型多样度为0.974 0~0.998 0；核苷酸多样度为0.017 20~0.022 22；全群平均核苷酸差异数K为20.795。NJ系统发育树表明，河北小尾寒羊与洼地绵羊先聚在一起，再与湖羊聚在一起，最后与苏尼特羊和山东小尾寒羊聚在一起。在所有的系统发育树及单倍型网络结构图中，均表明108种单倍型聚为3个单倍型群，单倍型群A包括70只绵羊个体，单倍型群B包括48只绵羊，单倍型群C包括13只绵羊。河北小尾寒羊与洼地绵羊遗传距离最近，其次为湖羊、苏尼特羊、山东小尾寒羊。该种群遗传多样性丰富，与山东小尾寒羊、苏尼特羊、湖羊、洼地绵羊等种群存在基因交流。

关键词：地方绵羊,线粒体基因组,起源,遗传多样性,

基金资助：河北省科技支撑计划项目（15226308D）