玉米叶夹角的全基因组关联分析

来源：华北农学报杂志2018年第1期北京时间：

作者：孙娇, 赵美爱, 潘顺祥, 裴玉贺, 郭新梅, 宋希云

单位：1. 青岛农业大学 生命科学学院, 山东 青岛 266109;；2. 青岛农业大学 农学与植物保护学院, 山东 青岛 266109;；3. 青岛农业大学 青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室, 山东 青岛 266109

摘要：为了阐述玉米叶夹角的遗传基础并定位相关的数量性状位点，利用289份常用玉米自交系为试验材料，在自然条件下测量玉米穗上叶夹角，对其进行性状分析，结果表明，各个环境的穗上叶夹角数据呈正态分布，并且各个环境间的数据呈极显著正相关。同时采用MaizeSNP50基因芯片进行基因分型，利用R平台下的farmCPU对叶夹角进行全基因组关联分析。在4个环境中共检测到42个与玉米叶夹角显著关联（P < 0.000 01）的SNP，其中1，5，8号染色体在4个环境下都检测到与穗上叶夹角紧密关联的SNP标记。对筛选出的所有标记综合分析，共鉴定出15个与玉米叶夹角相关的SNP标记位点，分布在Bin1.02、Bin1.03、Bin1.06、Bin1.11、Bin2.05、Bin3.04、Bin5.03、Bin5.04、Bin8.03、Bin8.04、Bin10.07处。采用全基因组关联分析的方法发掘叶夹角基因位点及候选基因，对揭示玉米叶夹角的遗传机理，加速玉米育种进程具有重要的意义。

关键词：叶夹角,相关性分析,关联分析,

基金资助：国家自然科学基金项目（31371636）；山东省现代农业产业技术体系玉米产业创新团队项目（SDAIT-01-022-01）；山东省农业良种工程；山东省农业生物资源创新利用研究课题；青岛市应用基础研究计划项目（14-2-4-13-jch）