苦瓜MAP30基因启动子克隆与单倍型分析

来源：华北农学报杂志2018年第1期北京时间：

作者：刘子记, 朱婕, 牛玉, 杨衍

单位：1. 中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所, 农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室, 海南 儋州 571737;；2. 海南大学 热带农林学院, 海南 海口 570228

摘要：为探明MAP30基因的表达调控规律，从苦瓜种质Y5中克隆了MAP30基因上游包括起始密码子在内1 682 bp序列，选取转录起始位点上游1 500 bp序列利用PlantCARE在线启动子预测工具进行分析，结果表明：MAP30启动子除了含有核心元件TATA-box和CAAT-box外，还含有大量的光响应元件、植物激素脱落酸响应元件、热胁迫响应元件、干旱应答元件、水杨酸应答元件等，该预测结果表明，MAP30启动子可能参与光、厌氧、逆境胁迫、脱落酸、水杨酸和乙烯等诱导，同时它还可能参与胚乳高效表达及昼夜节律调控。以30份苦瓜种质为材料，分析了MAP30启动子区域SNPs和InDels分布情况，共发现37个SNPs位点和6个InDels，SNPs分组发现，30份苦瓜种质资源MAP30基因启动子共存在3种单倍型，Y5、Y7、Y16、Y39、Y58、Y60、Y66、Y77、Y83、Y96、Y100、Y112、Y121属于第1组，Y43、Y50、Y90、Y108、Y113、Y115、Y140、Y141、Y144属于第2组，Y69、Y72、Y85、Y131、Y139、Y146、Y147、Y153属于第3组。结合顺式调控元件的位置，其中5个SNPs，342位点的T/C，584位点的A/G，783位点的G/T，872位点的A/G，1087位点的T/G，位于顺式调控元件内部，涉及的顺式调控元件分别为MBSI、ABRE、ARE、5UTR Py-rich stretch、GAG-motif、TC-rich repeats，SNP导致转录因子结合位点发生改变，可能对MAP30基因的表达调控有重要作用。为进一步揭示MAP30基因转录调控机制奠定理论基础。

关键词：苦瓜,<em>MAP30</em>,启动子,单倍型,

基金资助：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目（1630032014019；1630032015015；1630032016019）；国家自然科学基金资助项目（31601758）