蓖麻RcDELLA基因的克隆及序列分析

来源：华北农学报杂志2018年第1期北京时间：

作者：李威, 李国瑞, 黄凤兰, 丛安琪, 李晓晨, 白英俊, 李孟建, 陈永胜

单位：1. 内蒙古民族大学, 内蒙古 通辽 028000;；2. 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 内蒙古 通辽 028000;；3. 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 内蒙古 通辽 028000;；4. 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 内蒙古 通辽 028000

摘要：DELLA家族蛋白是植物GA信号途径的重要阻遏蛋白，能抑制植物的生长和发育，使植株产生矮化的表型。为了明确DELLA基因在蓖麻中的作用和功能，对RcDELLA基因进行生物学信息分析。以蓖麻2129六叶期茎尖的cDNA为模板，根据NCBI公布的DELLA （XM_002533984.2）蛋白基因片段设计引物，克隆该基因，并对其进行生物信息学分析。克隆得到该基因的完整阅读框，该基因编码序列全长为1 701 bp，编码567个氨基酸，推测其分子量为62 550.40 ku，等电点为5.14。二级结构预测表明α-螺旋占40.4%，β-折叠占8.6%，无规则卷曲占51.0%。系统进化树结果表明，RcDELLA先与大戟科巴西橡胶树和麻疯树形成分支。通过PCR扩增得到了RcDELLA基因的完整阅读框，同源性比对结果显示，RcDELLA具有典型的DELLA结构域，与NCBI上公布的其他植物的DELLA蛋白序列具有高度的同源性。系统进化树结果显示，与麻疯树亲缘关系最近，符合进化关系。生物信息学分析将为进一步研究DELLA基因在蓖麻矮化过程中的作用和功能奠定理论基础。

关键词：蓖麻,DELLA,序列分析,系统进化,

基金资助：国家自然科学基金项目（31460353）；内蒙古民族大学市校合作项目（SXZD2012006；SXZD2012017）；2015年全区研究生科研创新资助项目（S20151013601）；内蒙古自治区科技创新引导项目（KJCX15002）；内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心项目；内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目（MDK2016030）