利用InDel指纹图谱评价鲁西南地区簇生朝天椒品种的相似度

来源：华北农学报杂志2018年第2期北京时间：

作者：姜童, 王辉, 陈宁, 付翔, 杨延杰, 林多

单位：青岛农业大学 园艺学院, 青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室, 山东 青岛 266109

摘要：通过研究鲁西南地区簇生朝天椒生产用种的农艺性状，构建分子指纹图谱，为在分子水平结合农艺性状评价簇生朝天椒品种间的相似度提供支撑，同时也为簇生朝天椒的品种评价、品种保护及种子市场规范化管理奠定基础。以商品名不同的8个鲁西南地区簇生朝天椒品种为试验材料，进行单株簇数、每簇果数、鲜单果重、干单果重、色价等指标的调查，采用UPGMA聚类分析进行品种间的农艺性状相似度评价。采用试剂盒法提取基因组DNA，利用其他生物学性状差异较大的8份辣椒材料，筛选出25对多态性InDel引物，构建数字化InDel分子指纹图谱。利用农艺性状和DNA指纹图谱综合对簇生朝天椒进行品种相似度评价。通过农艺性状调查结果表明，8个商品名不同的簇生朝天椒品种抗倒伏性均较好、株型紧凑、产量较高、综合表现较一致；8个品种间遗传距离为0.78时聚为1个大类，各品种表型性状与遗传背景表现一致，亲缘关系相对较近，品种相似度较高。利用25对具有多态性的InDel引物进行8个品种的指纹图谱构建，共扩增出 160个位点，扩增片段大小在 130~350 bp，8个品种间只在引物CIDH267产生位点差异，扩增片段大小在180~200 bp。参照DNA指纹方法判定标准（NY/T1433-2007），品种SYJ-2和SYJ-6与品种SYJ-1、SYJ-3、SYJ-4、SYJ-5、SYJ-7、SYJ-8 为疑似同种。基于农艺性状和25对InDel标记构建的DNA指纹图谱可有效评价品种间的相似度，8个商品名不同的簇生朝天椒品种间农艺性状差异较小、遗传背景较窄、相似度极高，同质化严重，且存在同物异名现象。

关键词：簇生朝天椒,相似度评价,农艺性状,InDel标记,指纹图谱,

基金资助：山东省农业良种工程资助项目（2016LZGC011）；山东省自然科学基金项目（ZR2014CQ034）；青岛农业大学高层次人才科研基金项目（6631115041）