《华北农学报杂志》发表论文赏析

柠条锦鸡儿CkF5H基因及启动子的克隆

来源:华北农学报杂志2018年第2期北京时间:

作者:任方媛, 李高, 张涛, 杨杞, 王瑞刚

单位:内蒙古农业大学 生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010018

摘要:为了研究CkF5H基因在柠条锦鸡儿中木质素生物合成途径方面中的生物学功能,以我国西北干旱荒漠地区重要的豆科饲用灌木柠条锦鸡儿为材料,克隆了1个木质素合成相关的CkF5H基因,该基因cDNA全长1 679 bp,gDNA全长3 495 bp,具有2个外显子,1个内含子,编码520个氨基酸,GenBank登录号HQ829862。通过染色体步移的技术克隆了1 550 bp的启动子序列,对启动子序列上的响应元件进行了分析。结果显示,具有昼夜节律响应元件、防御与胁迫响应元件、赤霉素顺式作用元件和热响应元件等。CkF5H富含二级结构,其中α螺旋占39.81%,β折叠占15.96%,不规则卷曲占44.23%,并预测其三维结构。对CkF5H基因推导的氨基酸序列预测分析得出,CkF5H蛋白等电点为6.45,分子量为58.09 ku,不稳定系数45.72,是不稳定蛋白,总平均亲水性-0.143,属亲水性蛋白。因此,克隆柠条锦鸡儿的CkF5H基因并详细分析,可为进一步研究该基因提供理论依据。

关键词:柠条锦鸡儿,<em>F5H</em>,基因克隆,木质素,RACE,

基金资助:国家自然科学基金项目(31360169);内蒙古科技创新团队项目(201503004)

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