基于高通量测序分析河北省中南部地区耕地土壤细菌多样性

来源：华北农学报杂志2018年第4期北京时间：

作者：张翔, 宋水山, 黄亚丽, 贾振华, 黄媛媛, 宋聪

单位：1. 河北省科学院 生物研究所, 河北 石家庄 050081;；2. 河北科技大学 生物科学与工程学院, 河北 石家庄 050000;；3. 河北省主要农作物病害微生物控制工程技术研究中心, 河北 石家庄 050081

摘要：为了研究大棚土壤与大田土壤中细菌多样性的差异，利用Miseq高通量测序技术，对河北省南部地区大棚与大田土壤的14个样品进行测序，并得到了2组样品中的物种组成信息与相对丰度信息。结果表明，在大棚（M1）与大田（N1）土壤样品中，优势菌群的组成基本一致，在门水平有变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门和芽单胞菌门这7个细菌门类，其中，放线菌门在大田中的相对丰度多，厚壁菌门在大棚中的相对丰度较多。在纲水平有α-变形菌纲、酸杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲、Δ-变形菌纲、β-变形菌纲、芽单胞菌纲、纤维粘网菌纲等15种优势菌群，其中，大棚中相对丰度明显增高的是纤维黏网菌纲、杆菌纲和黄杆菌纲等，而相对丰度明显降低的是酸杆菌纲和β-变形菌纲等。在属水平有节细菌属、鞘氨醇单胞菌属、德沃斯氏菌属、芽孢杆菌属、黄单胞菌属和溶杆菌属6个优势菌群，其中，节细菌属在大田中较多，而芽孢杆菌属、黄单胞菌属和溶杆菌属在大棚中较多。另外，一些具有固氮和降解修复能力的菌群在大田中的相对丰度要高一些。这应该是由大田与大棚不同的种植环境导致的。研究结果对改善耕地土壤，提高产量与抗病能力有一定的价值。

关键词：高通量测序,大棚土壤,大田土壤,细菌多样性,

基金资助：河北省科技条件建设项目（16967518D）；河北省科技基础资源共享专项科技基础条件建设项目（17962907D）