不同鸡品种BLEC1基因序列比较分析

来源：华北农学报杂志2018年第4期北京时间：

作者：张莘, 常国斌, 郑圣晗, 王统苗, 陈博雯, 张扬, 王志秀, 陈国宏

单位：扬州大学 动物科学与技术学院, 江苏 扬州 225009

摘要：BLEC1基因（C-type lectin-like receptor 1）编码C型凝集素样受体区域，与CD69家族的激活抗原相关，密切联系于禽类的先天性免疫功能。为了探究BLEC1基因在鸡中的遗传多样性以及不同鸡品种之间的抗病性差异，用苯酚和氯仿法提取26个不同鸡品种的DNA，对其BLEC1基因序列进行目标捕获测序，然后以NCBI上红色原鸡的BLEC1基因序列作为参考序列，序列号为NC_006103.4，通过MEGA 6软件对26个鸡品种的BLEC1基因序列进行序列比对分析，筛选出不同鸡种BLEC1基因序列上的SNPs位点和Indels位点以及对应氨基酸的变化，并根据基因序列的差异运用邻接法系统聚类分析构建进化树。在26个鸡品种中共检测到14个SNPs位点和12个Indels位点，其中有5个SNPs位点和3个Indels位点在外显子上，外显子上的3个Indels位点在鸡种中广泛存在，且Indel1存在于除黑狼山鸡以外的所有鸡种中，这些SNPs位点和Indels位点导致氨基酸发生极大改变，外显子中氨基酸有3个发生错义突变，其余为同义突变。邻接法系统聚类分析将26个鸡品种分为3大类，其中，安卡鸡、SPF-来航鸡和泰和乌骨鸡聚为一类；萧山鸡单独为一类；其余鸡种聚为一类。综上表明，BLEC1基因在我国地方鸡品种中有着丰富的遗传多样性，且与不同鸡种的先天性免疫功能和抗病性相关。

关键词：鸡,BLEC1基因,SNPs,Indels,进化树,

基金资助：国家科技支撑计划项目（2015BAD03B03）；江苏省六大人才高峰项目（2015-NY-019）