牦牛IGF-IR基因克隆及其序列分析

来源：华北农学报杂志2018年第4期北京时间：

作者：梁春年, 王宏博, 吴晓云, 褚敏, 郭宪, 阎萍

单位：1. 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃 兰州 730050;；2. 甘肃省牦牛繁育重点实验室, 甘肃 兰州 730050

摘要：为研究牦牛胰岛素样生长因子1受体基因（IGF-IR）的结构和功能，采用同源克隆和RT-PCR方法分段扩增牦牛IGF-IR，拼接获得全长序列，利用生物学软件进行分析。结果表明，牦牛IGF-IR基因ORF长约4 104 bp，编码1 367个氨基酸；理论分子量约154.95 ku，等电点pI值约5.71。与黄牛IGF-IR比较，牦牛IGF-IR基因序列有20处碱基改变，其中G到T碱基颠换2次，G到A碱基转换2次，C到T碱基转换7次，A到G碱基转换3次，T到C碱基转换6次，以及3个位点氨基酸改变（G6R、T29I和S30I）。系统进化分析表明，牦牛与黄牛、猪、人、狗、小鼠、猩猩等物种IGF-IR氨基酸相似性均大于92%，处于同一进化分支，具有高度同源性。蛋白结构预测表明，牦牛IGF-IR包含半胱氨酸富集区（FU）、纤连蛋白Ⅲ型结构域（FN3）、跨膜结构域（TM）及酪氨酸蛋白激酶区（TyrKc），具有该受体家族的特征结构域。同源建模表明，其成熟区段氨基酸序列与人的IGF-IR有98.68%的相似性。为后续牦牛IGF-IR基因的功能研究奠定了基础。

关键词：牦牛,IGF-IR基因,克隆,序列分析,

基金资助：国家重点研发计划项目（2018YFD0502400）；甘肃省草食畜产业技术体系；中国农业科学院牦牛资源与育种创新团队（CAAS-ASTIP-2014-LIHPS）