《华北农学报杂志》发表论文赏析
作者:张俊环, 孙浩元, Boris Krška, 杨丽, 姜凤超, 张美玲, 王玉柱
单位:1. 北京市林业果树科学研究院, 北京 100093;;2. 孟德尔大学 园艺学院, 布尔诺 69144
摘要:为快速检测引进杏资源是否携带李痘病毒(PPV),并从国内资源中筛选抗PPV材料,通过RT-PCR和荧光定量PCR 2种方法的比较验证,确定了RT-PCR为快速、准确、经济高效检测杏PPV病毒病的方法,并明确了PCR扩增体系和反应条件的具体参数。扩增体系为20 μL,包括10×Buffer 2 μL、25 mmol/L Mg2+ 1.6 μL、10 mmol/L dNTP 0.4 μL、0.5 U/μL Taq酶0.2 μL、上下游引物各0.4 μL、模板cDNA 1 μL、ddH2O 14 μL。RT-PCR反应条件:94℃预变性5 min,然后以94℃变性45 s、55℃退火30 s、72℃延伸45 s,进行35个循环,72℃延伸10 min。利用捷克孟德尔大学园艺学院构建的杏PPV抗性分离F1群体,采用SSR分子标记技术和集团分离分析法(BSA)相结合的策略,首先在抗PPV和易感PPV的对等基因间进行多态性标记的筛选,初步筛选得到6个SSR位点(PGS1.23、PGS1.24、PaCITA5、UDAP-414、Pchcms4和Pchgms4)在两亲本间和2个对等基因池间的多态性是一致的,并进一步在F1分离群体间进行复选和验证,最终筛选到1个与PPV抗性性状连锁程度较高的SSR分子标记PGS1.23,此标记检测杏资源分离群体PPV抗性的符合度达到了78.3%。进而利用该标记在37份我国杏种质中进行了PPV抗性评价,结果筛选出了5份抗PPV的杏资源,分别是菜籽黄、杨继元、垂枝山杏、大早熟和媳妇杏,为今后杏的抗PPV育种提供较好的亲本材料,也为进一步挖掘抗PPV基因的深度研究奠定了基础。
关键词:李痘病毒,杏,分子检测,SSR,BSA,
基金资助:国家林业局“948”项目(2013-4-50);国家自然科学基金项目(31401836);北京市自然科学基金项目(6162012);北京市农林科学院青年基金项目(QNJJ201702);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX2016)