内蒙古绒山羊(阿拉善型)线粒体基因组序列测定及分析

来源：华北农学报杂志2018年第5期北京时间：

作者：苏蕊, 杨钟, 丽春, 李晓凯, 马宇浩, 李金泉

单位：1. 内蒙古农业大学 动物科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010018;；2. 农业部肉羊遗传育种重点实验室, 内蒙古 呼和浩特 010018;；3. 呼和浩特市疾病预防控制中心, 内蒙古 呼和浩特 010070;；4. 内蒙古民族大学 动物科学技术学院, 内蒙古 通辽 028000

摘要：为了研究内蒙古绒山羊线粒体基因组序列组成及不同品种系统发育关系，明确绒山羊的起源、进化、不同类群的分化以及特定遗传特性形成机制，以内蒙古绒山羊（阿拉善型）为试验研究对象，对其线粒体基因组进行了序列测定和分析。结果表明，测序共得到2 551 175 100 bp碱基数，Q20为95.40%，文库构建质量好，测序结果准确性高，得到长度为16 642 bp完整的闭合环状线粒体基因组，其GC含量为39.17%，K-mer为53 bp。从NCBI下载其他绒山羊品种的线粒体基因组序列信息，进行系统发育分析，结果表明，内蒙古绒山羊的3个类群距离比较近，其中，阿拉善型和二狼山型的关系最近，阿尔巴斯次之；内蒙古绒山羊和辽宁绒山羊可以分为单独的2个类群，与国外品种San Clemente的距离最远。

关键词：绒山羊,线粒体,基因组,

基金资助：国家绒毛用羊产业技术体系项目（CARS-39-06）；国家自然科学基金项目（31660639；31402052）；内蒙古研究生教育创新计划资助项目（B20171012901Z）