《华北农学报杂志》发表论文赏析

小反刍兽疫病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立

来源:华北农学报杂志2018年第S1期北京时间:

作者:李林杰, 刘萍, 马鹏, 王悦萦, 郭富城, 马晓霞, 周建华, 柏家林

单位:1. 西北民族大学 生物医学研究中心, 甘肃 兰州 730030;;2. 西北民族大学 生命科学与工程学院, 甘肃 兰州 730030;;3. 中国农业科学院 兰州兽医研究所, 甘肃 兰州 730046

摘要:为了建立一种快速检测小反刍兽疫病毒的方法。根据GenBank中公布的PPRV Nigeria75/1株H基因序列设计2对引物,PCR扩增出1 830 bp H基因,构建标准质粒pMD-18-H。以标准质粒优化反应条件,建立了小反刍兽疫病毒H基因SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法。最优反应体系25 μL:2×SYBR qPCR Mix 12.5 μL,模板DNA 1 μL,特异引物各0.2 μL(0.2 μmol/L),DEPC H2O 10.5 μL;最佳反应条件:94℃ 2 min;94℃ 5 s,57℃ 30 s,40个循环,Ct值与标准质粒模板浓度在3.28×104~3.28×10-2 copies/μL 7个浓度梯度呈良好线性关系y=-2.913 x+36.904,斜率为-2.913,扩增效率120.5%,相关系数R2=0.994。建立的实时荧光定量PCR检测方法比普通PCR灵敏度高10 000倍,稳定性好,特异性强,对PPRV的准确诊断和定量检测具有重要意义。

关键词:小反刍兽疫病毒(PPRV),SYBR Green Ⅰ,实时荧光定量PCR,

基金资助:国家自然科学基金项目(31860696);西北民族大学“双一流”引导专项-生物工程特色学科(10018703);动物医学生物工程创新团队发展计划(IRT_17R88);甘肃省科技计划项目(17YF1WA166);国家自然科学基金项目(31260533)

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