基于线粒体DNA控制区序列分析我国马鹿5个亚种的遗传分化

来源：华北农学报杂志2018年第S1期北京时间：

作者：涂剑锋, 徐佳萍, 王洪亮, 李一清, 邢秀梅

单位：中国农业科学院 特产研究所, 特种经济动物分子生物学国家重点实验室, 吉林 长春 130112

摘要：为了解马鹿种群遗传结构和分化水平，测定了马鹿5个亚种11个地理群共计146个体线粒体DNA控制区全序列。序列分析检测到167个变异位点，确定了54种单倍型；各个亚种呈现较高的单倍型多样性（h：0.600~0.959）及中等程度的核苷酸多样性（π：0.006 3~0.012 6）。中性检验仅发现甘肃马鹿显著性偏离中性突变，亚种间遗传分化指数FST>0.5、基因流Nm<0.5，表明马鹿亚种间发生了显著的遗传分化，只存在少量基因交流。基于最大简约法和贝叶斯法构建的单倍型系统进化树和单倍型中介网络图显示塔里木马鹿有别于其他马鹿，它们分别来源于共同祖先的2个不同进化枝，阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、阿拉善马鹿、天山马鹿又可细分为3个进化枝系，但它们是相互交叉聚类的。为我国马鹿的遗传资源保护和利用提供依据。

关键词：马鹿,线粒体控制区,单倍型,遗传分化,基因流,

基金资助：吉林省科技发展计划项目（20150519016JH）