SSR标记与陆地棉田间黄萎病抗性的关联分析

来源：华北农学报杂志2018年第6期北京时间：

作者：张素君, 唐丽媛, 李兴河, 王海涛, 刘存敬, 张香云, 张建宏

单位：河北省农林科学院 棉花研究所, 农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室, 国家棉花改良中心河北分中心, 河北 石家庄 050051

摘要：通过关联分析挖掘与陆地棉黄萎病抗性关联的分子标记，为陆地棉抗黄萎病性状的分子检测及标记辅助选择育种提供有益参考。选用在棉花基因组上均匀分布多态性较好的237个SSR标记对214份陆地棉材料的基因组变异进行了扫描，并使用PowerMarker v3.25分析群体的遗传多样性，Structure 2.2分析群体结构，在此基础上结合3年黄萎病抗性鉴定数据，采用Tassel 2.1中的GLM（Q）方法挖掘与黄萎病抗性相关的QTLs。结果表明，不同陆地棉材料黄萎病发病情况差异显著；237个标记共检测到280个多态性位点，共计695个等位变异，变异范围2~6个，平均等位变异数2.479 0；按照基因型数据可将该群体划分为2个亚群；通过关联分析，在不同年份中发掘与黄萎病抗性显著关联（P<0.01）的SSR位点27个，其中有2个位点（BNL3442和BNL1064）在3年均被重复检测到，表型变异解释率最高分别为12.10%和8.02%。这些在不同年份中稳定存在的SSR标记位点有可能与抗病基因紧密连锁，有望用于棉花黄萎病抗性材料筛选和抗病基因挖掘。

关键词：陆地棉,SSR,黄萎病抗性,关联分析,

基金资助：棉花杂种优势利用技术与强优势杂交种创制项目（2016YFD0101415）；河北省财政项目（F17R2017039263）；棉花生物学国家重点实验室开放课题基金（CB2018A15）