miR-181a-5p靶基因预测及其在鹅卵泡颗粒层中的表达分析

来源：华北农学报杂志2018年第6期北京时间：

作者：莫远亮, 邓艳, 王继文

单位：四川农业大学 动物科技学院, 畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室, 四川 成都 611130

摘要：为深入探究miR-181a-5p在鹅颗粒细胞中可能的功能及其作用机制奠定基础。以多个网络数据库资源为基础，通过生物信息学的方法预测可能的靶基因及其信号通路，然后利用qPCR检测miR-181a-5p及其靶基因在不同阶段颗粒层中的表达水平。结果显示，miR-181a-5p在脊椎动物中高度保守；靶基因的GO和KEGG分析发现，miR-181a-5p主要参与调控细胞的增殖、分化、凋亡等过程，多数靶基因主要富集到FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路；根据靶基因互作网络图，筛选出10个核心靶基因VEGFA、MAPK1、FOS、KRAS、HRAS、SIRT1、BCL2、ESR1、PTEN和CDKN1A，其中多数靶基因均与细胞增殖凋亡相关。结果表明，miR-181a-5p在2~4 mm表达量最高，但在4~6 mm急剧下降，之后在4~6 mm、8~10 mm、F5这3个阶段均呈现显著上升趋势。miR-181a-5p可能通过靶向调控SIRT1、BCL2、CDKN1B、PTEN等基因，参与FOXO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路来调控颗粒细胞的增殖凋亡过程。

关键词：<em>miR-181a-5p</em>,GO和KEGG分析,表达分析,颗粒细胞,增殖,凋亡,

基金资助：国家现代水禽产业技术体系（CARS-42-4）；国家科技支撑计划项目（2015BAD03B06）；国家自然科学基金项目（31672424）