《华北农学报杂志》发表论文赏析
作者:张鹏钰, 刘毓侠, 曹丽茹, 袁珍, 王国瑞, 王同朝, 尹钧, 卫丽
单位:1. 河南农业大学 河南粮食作物协同创新中心, 河南 郑州 450002;;2. 河南农业大学, 河南 郑州 450002;;3. 河南省农业科学院, 河南 郑州 450002;;4. 国家小麦工程技术研究中心, 河南 郑州 450002
摘要:为进一步挖掘小麦逆境胁迫响应基因在植物非生物逆境胁迫应答中的作用,探究小麦逆境胁迫响应机制,从前期转录组结果中筛选出1个编码MYB蛋白的基因,暂命名为Tamyb59,通过PCR技术扩增Tamyb59的全长;利用NCBI和DNAMAN软件进行基因序列比对和保守结构域的分析;利用Expasy和TMHMM等在线软件进行氨基酸组成、亲水系数分析;采用MEGA 6.0软件构建系统进化树;构建pMDC83-GFP融合表达载体,进行基因表达的亚细胞定位分析。采用qRT-PCR分析了基因在不同非生物胁迫处理过程中不同组织的表达特性,并利用SAS数据处理软件进行差异显著性分析。结果表明:该基因含有典型的SANT保守结构域,CDS序列全长为522 bp,编码173个氨基酸,编码蛋白分子质量为19.7 ku,理论等电点为7.61。基因系统进化分析结果表明,Tamyb59与山羊草、粳稻、玉米等9种植物MYB转录因子有52.0%~85.6%的同源性,其中与谷子的MYB蛋白同源性最高。亚细胞定位结果显示,Tamyb59基因编码蛋白定位在细胞核。利用qRT-PCR分析了基因在不同非生物胁迫处理过程中不同组织的表达特性,组织表达特异性分析显示,Tamyb59基因在小麦根中的表达量较高,茎、叶和幼穗中表达量较低;PEG和盐胁迫处理过程中,Tamyb59基因的表达均呈现先上升后下降的趋势,说明Tamyb59基因对不同非生物胁迫有不同的响应。
关键词:小麦,<em>Tamyb59</em>基因,基因克隆,非生物胁迫,表达分析,
基金资助:国家自然科学基金项目(31471452);河南省科学技术研究计划项目(182102110101);国家重点研究发展计划项目(2017YFD0301106)