向日葵锈菌弹性金属蛋白酶基因克隆及生物信息学分析

来源：华北农学报杂志2019年第3期北京时间：

作者：李鑫淳, 宋阳, 路妍, 景岚

单位：内蒙古农业大学 农学院, 内蒙古 呼和浩特 010019

摘要：为了研究向日葵锈病的致病机制，将向日葵锈菌转录组中表达量较高的一个基因（KU994904）中成熟部分进行生物信息学分析及基因克隆。利用Interpro对蛋白ORF区域进行分析，确定其成熟区域，通过生物信息学相关软件对其进行结构预测及预测分析，从向日葵锈菌中提取总RNA，并利用RT-PCR方法扩增此蛋白酶成熟基因并克隆。结果显示：该蛋白酶成熟基因序列全长1 335 bp，编码445个氨基酸，分子质量49.5 ku，其与M36家族中5条序列具有较高相似性，并发现同胞外金属蛋白酶基因序列相似度达到53.77%。因此，推断其为弹性金属蛋白酶。

关键词：向日葵锈菌,弹性金属蛋白酶,克隆,生物信息学分析,

基金资助：国家自然科学基金项目（31760509；31360422）；国家向日葵现代产业技术体系（CARS-16）