一组新的小麦EST-SSR标记开发及其 在遗传图谱构建中的应用

来源：华北农学报杂志2020年第4期北京时间：

作者：吕冰冰, 代畅, 彭正松, YAMAMOTO Naoki, 吴一超, 魏淑红, 杨在君

单位：1. 西华师范大学 生命科学学院, 西南野生动植物资源保护教育部重点实验室, 四川 南充 637009;；2. 西昌学院 农业科学学院, 四川 西昌 615013

摘要：为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引物中有555对能在亲本川麦42和川农16中扩增出稳定清晰的条带，引物有效性为94.87%。其中有44对EST-SSR引物在川麦42和川农16中表现出明显的、稳定的多态性，多态性率为7.93%。所构建的遗传图谱中含有本次新开发的EST-SSR标记的连锁群共12个，由163个标记组成，包括17个EST-SSR标记，73个SSR标记和73个SRAP标记，覆盖小麦基因组长度1 551.5 cM，相邻标记之间的平均距离为13.11 cM。本研究丰富了小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。

关键词：小麦,EST-SSR标记,遗传图谱,RIL,

基金资助：国家自然科学基金项目（31760425）；西华师范大学英才基金项目（17YC355）