合作猪StAR基因克隆、组织表达及生物信息学分析

来源：华北农学报杂志2023年第4期北京时间：

作者：闫尊强, 计亚楠, 王鹏飞, 张博, 石海霞, 滚双宝

单位：1 甘肃农业大学 动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070；2 甘肃省现代养猪工程技术研究中心,甘肃 兰州 730070

摘要：旨在对合作猪StAR基因CDS区进行克隆及生物信息学分析,采用RT-qPCR方法检测StAR基因在不同组织中的表达量,以揭示其功能。结果发现,合作猪StAR基因CDS区长858 bp,编码285个氨基酸,与猪参考序列相比,第572位点处的A突变为G,导致第191位的赖氨酸突变成精氨酸,为错义突变,第791位点处插入1个碱基C,后续的20个氨基酸发生改变,导致移码突变;蛋白分子量90.95 ku,理论等电点8.87;消光系数33 835,不稳定系数41.49;含1个N-糖基化位点,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲构成,二级结构与三级结构基本一致;合作猪与猪、绵羊和黄牛StAR基因核苷酸序列相似性分别为99.77%,90.45%,91.78%;进化树结果显示,合作猪与猪亲缘关系最近,表明StAR基因编码序列具有种属特异性;StAR蛋白是不稳定的亲水性蛋白,无信号肽和跨膜区;StAR基因在脾、肾、肺等组织中均有表达,睾丸表达量较高,表明可能与合作猪睾丸发育有关。

关键词：合作猪,<i>StAR</i>基因,生物信息学,组织表达,

基金资助：甘肃省教育科技创新项目(GSSYLXM-02); 鲁甘科技协作项目(YDZX2021113); 2022年现代丝路寒旱农业科技支撑项目(GSLK-2022-10)