《华北农学报杂志》发表论文赏析

桃叶片低温响应转录组分析

来源:华北农学报杂志2023年第S1期北京时间:

作者:时梦, 冀晓昊, 杨兴旺, 王莹莹, 王海波, 王孝娣

单位:中国农业科学院 果树研究所,农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室,辽宁 葫芦岛 125000

摘要:抗寒是桃育种工作重要的目标性状,受多个基因的调控,转录组测序是对特定生理条件下的转录本进行测序分析,用以深入探究桃叶片低温响应的分子机制。以熊岳巨桃的叶片为试验材料对4 ℃低温(LT)处理下和正常叶片(RT)进行转录组测序分析。利用DESeq2进行差异表达分析,获得72个上调差异表达基因和3个下调表达基因。KEGG代谢通路分析差异表达基因的代谢通路,并进行蛋白的互作预测。结果显示,低温处理的叶片呈现卷曲、变黄和失水的生理状态,差异代谢基因主要富集在植物病原体互作、MAPK信号通路和次生物质代谢积累等途径。MYC2、SPCH 和Pti4~6转录因子可能在响应冷胁迫中调节低温带来的伤害中起到重要作用,MYC2和CBF蛋白预测相互作用,且分别与多个蛋白互作。本研究表明,有多个代谢途径共同响应桃叶片的低温胁迫,还预测到了可能在冷反应调节途径中起到关键作用的相关转录因子,为探究桃响应冷胁迫的分子机制打下基础。

关键词:桃,叶片,低温,转录组分析,

基金资助:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(Y2021YJ23); 中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2015-RIP-06); 国家重点研发计划(2020YFD1000203)

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