菲律宾蛤仔RP2基因的克隆及组织表达分析

来源：大连海洋大学学报杂志2015年第2期北京时间：

作者：裴爱君, 杨艳津, 秦艳杰, 赵祥吉, 闫喜武, 李霞, 王福景

单位：大连海洋大学 辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心，辽宁 大连 116023

摘要：采用反转录PCR(RT-PCR)与cDNA末端快速克隆(RACE)法首次从壳长为28 mm的菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum外套膜中克隆出RP2基因(GenBank登录号:KF826881)。结果表明：RP2基因cDNA序列长度为1158 bp，包括62 bp的5′端非编码区，41 bp的3′端非编码区，开放阅读框1053 bp，编码350个氨基酸;推导的氨基酸序列具有TBCC(57aa~175aa)和CARP(65aa~102aa)保守结构域，并为非跨膜糖蛋白;经Blast同源性比较表明，菲律宾蛤仔RP2氨基酸序列与太平洋牡蛎Crassostrea gigas的相似性较高(56%)，与高等哺乳动物、鸟类、鱼类、两栖类和节肢动物各模式动物之间的相似性为43%~53%，与非洲眼线虫Loa loa的相似性较低(33%);利用实时定量PCR技术检测RP2基因在菲律宾蛤仔不同组织中的表达，结果显示，RP2基因在菲律宾蛤仔雄性性腺中表达量最高，在鳃、水管和外套膜组织中次之，在斧足和闭壳肌中表达量极少，在雌性性腺中无表达。研究表明，RP2基因在菲律宾蛤仔各组织中的表达较为广泛，但不同组织的表达量存在明显差异，本研究结果可为无脊椎动物RP2基因的结构及其功能研究提供基础数据。

关键词：菲律宾蛤仔,视网膜色素变性基因2,分子克隆,组织表达分析