基于高通量测序分析海带表面细菌群落结构

来源：大连海洋大学学报杂志2017年第1期北京时间：

作者：孙丕海, 钱坤, 李晓丽, 杨志平, 丁鉴锋, 孙雪莹, 马悦欣

单位：1.大连海洋大学海珍品苗种培育基地,辽宁大连116023;2.大连金普新区海洋与渔业局,辽宁大连116100;3.大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连116023;4.大连汇新钛设备开发有限公司,辽宁大连116039

摘要：为研究大连登沙河湾和正明寺海带养殖区海带Saccharina japonica表面及其周围海域海水的细菌群落结构,分别于2015年1月、2月和4月,采用Illumina Miseq PE300高通量测序平台对样本基因组DNA 的16S rRNA基因V3～V4区PCR扩增片段进行测序分析。结果表明:从两个海区健康海带和海水中获得优化序列分别为130 158条和124 658条,海带序列可归为8个门和99个属,海水序列可归为14个门和135个属;在门水平,海带首要优势门为厚壁菌门 (＞69%),其次为变形菌门、蓝细菌门、放线菌门和拟杆菌门 (＞1%),海水首要优势门为变形菌门 (＞46%),其次为厚壁菌门、拟杆菌门、蓝细菌门和放线菌门 (＞1%);在属水平,海带主要优势属为乳球菌属 (＞40%)和芽孢杆菌属 (＞10%),其次为 Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属 (＞3%),海水首要优势属为弧菌属 (21.58%)和乳球菌属 (28.29%),其次为科尔韦尔氏菌属、弓形杆菌属和亚硫酸杆菌属 (＞2%)。研究表明,两个海区海带细菌群落组成相似,海带和海水细菌群落组成则明显不同。

关键词：海带,细菌群落,高通量测序

基金资助：辽宁省自然科学基金资助项目 (2015020800);大连市金州新区海洋与渔业局项目 (2014115,2014118)