《大连海洋大学学报杂志》发表论文赏析

红鳍东方鲀感染哈氏弧菌前后组织中socs3基因的表达差异分析

来源:大连海洋大学学报杂志2019年第1期北京时间:

作者:华昕彤, 刘鹰, 陈冰, 徐岩, 傅松哲, 姜晨

单位:1.大连海洋大学 水产设施养殖与装备工程技术研究中心,辽宁 大连 116023;2.大连海洋大学 水产与生命学院,辽宁 大连 116023;3.中国海洋大学 水产学院,山东 青岛 266000

摘要:为研究红鳍东方鲀Takifugurubripes免疫系统相关细胞因子信号传导抑制因子-3(Suppressor of cytokine signaling,SOCS3)的表达情况,采用相对实时荧光定量PCR方法比较了体质量为(290.34±5.13)g的健康红鳍东方鲀脑、脾脏、肠、鳃、肌肉和肝脏6个不同组织中socs3基因表达量,以及感染哈氏弧菌Vibrioharveyi后肝脏、脾脏和肠组织socs3基因表达量的变化。结果表明:socs3基因在健康红鳍东方鲀肝脏组织、肌肉组织中均有显著表达(P0.05);感染哈氏弧菌的红鳍东方鲀,在感染后的24、48 h时,肝脏组织socs3的表达量显著高于0 h(P0.05);利用NCBI的ORF Finder程序鉴定所得红鳍东方鲀SOCS3(NP_001072096.1)序列的潜在开放阅读框(ORF),通过模块化结构研究工具来鉴定保守结构域和信号肽,表明socs3的 cDNA序列全长1533 bp,其中5′ 端非编码区为215 bp,开放阅读框(ORF)长度为606 bp,3′ 端非编码区为713 bp,共编码201个氨基酸;利用MEGA 6.0软件进行氨基酸序列比对并构建系统发育树,结果显示,硬骨鱼类单独聚为一支,与哺乳动物、两栖动物及鸟类分开,硬骨鱼类中的SOC3b单独聚为一支,红鳍东方鲀与其同科的黑青斑河豚Tetraodonnigroviridis的SOC3聚在一起,并与三刺鱼Gasterosteusaculeatus属于同一分支。本研究结果可为红鳍东方鲀免疫应答的研究提供数据支持。

关键词:红鳍东方鲀,哈氏弧菌感染,组织socs3基因,差异表达,细胞因子免疫调节

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