逆转座子LINE1在Hela细胞中的表达及转录组分析

来源：大连海洋大学学报杂志2019年第2期北京时间：

作者：储旭, 周涛, 李文豪, 邢虎, 陈良标

单位：上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心，水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室，中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心,上海201306

摘要：为研究逆转座子LINE1(简称为L1)在Hela细胞内的作用机制，对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序,通过对转录组数据进行拼接组装，对差异表达基因进行了生物信息学分析。结果表明:试验共筛选出391个差异表达基因，其中45.6%的差异表达基因显著性上调,这些基因通过GO分类注释，可分为14类；通过KEGG对差异基因进行通路富集，表明差异基因主要富集在破骨细胞分化、色氨酸代谢、乙型肝炎、病毒致癌作用和可卡因成瘾等信号通路，发现了一些与细胞黏着连接、表皮相关的基因有差异性表达。研究表明，通过转录组测序，获得了丰富的关于L1在Hela细胞中表达的信息，为进一步研究L1在细胞中的作用机制供了思路和理论依据。

关键词：LINE1,Hela细胞,转录组测序,逆转座子