伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼皮肤微生物多样性的研究

来源：大连海洋大学学报杂志2019年第6期北京时间：

作者：赵文静, 许强华

单位：1.上海海洋大学 海洋科学学院，上海 201306；2.大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室，上海 201306；3.国家远洋渔业工程技术研究中心，上海 201306；4.远洋渔业协同创新中心，上海 201306

摘要：为研究南极鱼皮肤微生物群落的多样性，揭示不同种类南极鱼皮肤微生物的差异，提取伯氏肩孔南极鱼Trematomusbernacchii(TB)和革首南极鱼Nototheniacoriiceps(NC)皮肤微生物基因组总DNA，采用16S rDNA分子标记和高通量测序技术检测样品微生物群落多样性。结果表明：对两种南极鱼的6个样本分别进行测序，共获得有效序列数378 517条，获得操作分类单元(OTUs)740个；两种南极鱼皮肤的优势菌门包括厚壁菌门Firmicutes、变形菌门Proteobacteria、异常球菌-栖热菌门Deinococcus-Thermus、拟杆菌门Bacteroidetes、软壁菌门Tenericutes、放线菌门Actinobacteria等，以厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门的丰度较高；两种南极鱼皮肤的优势菌属为厌氧芽孢杆菌属Anoxybacillus、火山岩菌属Vulcaniibacterium、芽孢杆菌属Bacillus、嗜冷杆菌属Psychrobacter、青枯菌属Ralstonia、短波单胞菌属Brevundimonas、假单胞菌属Pseudomonas和嗜甲基菌属Methylophilus；同种南极鱼不同个体间皮肤微生物菌群差异较小，且伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼间皮肤微生物菌群无显著性差异(P>0.05)。研究表明，采用高通量测序可以精准地对两种南极鱼皮肤微生物主要菌群进行分析比较，厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门是伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼皮肤微生物的优势菌门，两种南极鱼间的皮肤微生物菌群无显著性差异。

关键词：伯氏肩孔南极鱼,革首南极鱼,高通量测序,皮肤微生物

基金资助：国家自然科学基金面上项目(31572598，31772826)；国家自然科学基金委国际(地区)合作与交流项目(4161101039)