高温胁迫下尼罗罗非鱼肝脏组织的转录组分析

来源：大连海洋大学学报杂志2021年第2期北京时间：

作者：魏亚丽, 周艳, 黄思婕, 鲁纪刚, 陈良标,

单位：1.上海海洋大学 海洋生物科学国际联合研究中心，上海 201306； 2.水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室，上海 201306； 3.水产科学国家级实验教学示范中心，上海 201306

摘要：为探究罗非鱼高温胁迫响应的调控作用机理，选用孵化12 d后的尼罗罗非鱼Oreochromisniloticus幼鱼，基于RNA-seq技术对尼罗罗非鱼高温处理组(36 ℃高温胁迫下养殖30、50、70 d)和常温对照组(28 ℃，30、50、70 d)肝脏组织样品进行转录组分析。结果表明：高温处理组与常温对照组共获得39.23 Gb clean data；28 ℃-30 d与36 ℃-30 d文库比较发现，存在4 342个差异基因，28 ℃-50 d与36 ℃-50 d文库比较发现，存在3 139个差异基因，28 ℃-70 d与36 ℃-70 d文库比较发现，存在3 042个差异基因；进一步将差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析，发现差异基因主要富集在糖酵解/糖异生、细胞周期、内质网的蛋白质加工及胰岛素信号等通路上；通过RT-qPCR试验对mTOR信号通路及相关通路中的8个差异基因进行验证，证实了转录组测序结果的可靠性。研究表明，高温胁迫下尼罗罗非鱼肝脏组织中参与热应激相关的基因涉及生长、蛋白质折叠及能量代谢等多个生物学过程，本研究结果为深入研究罗非鱼高温胁迫响应调控机制奠定了基础。

关键词：尼罗罗非鱼,高温胁迫,转录组,实时荧光定量PCR

基金资助：国家重点研发计划项目(2018YFD0900600);上海市科委“一带一路”国际联合实验室项目(19590750500);上海市教委科研创新计划项目(2017-01-07-00-10-E00060)