马氏珠母贝Kelch-like基因的序列及其SNP位点分析

来源：大连海洋大学学报杂志2022年第3期北京时间：

作者：杨创业, 张丞澍, 黄静, 郝瑞娟, 师尚丽, 黄荣莲, 周芮, 邱金玉, 颜翼龙, 邓岳文

单位：1.广东海洋大学 水产学院，广东 湛江 524088；2.广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心，广东 湛江 524088；3.广东省海水养殖生物育种工程实验室，广东 湛江 524088；4.南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江),广东 湛江 524006

摘要：为了探究马氏珠母贝PinctadafucatamartensiiKelch样基因(Kelch-like)的功能，对Kelch-like基因序列及其SNP位点进行了分析。结果表明：马氏珠母贝Kelch-like序列全长为2 127 bp，其中，5′UTR为58 bp，3′UTR为44 bp，其开放式阅读框长度为2 025 bp，可编码674个氨基酸；预测其Kelch-like氨基酸序列含有1个BTB结构域、1个BACK结构域和2个Kelch结构域；马氏珠母贝Kelch-like与美洲牡蛎Kelch-like氨基酸序列的一致性最高(35%)，其次为虾夷扇贝(32.05%)；马氏珠母贝Kelch-like氨基酸序列的BTB、BACK保守性较高，且Kelch具有保守的GG位点；Kelch-like基因在马氏珠母贝边缘膜组织的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05)，且贝壳损伤后6、12、120 h时该组织中的基因表达量显著上调(P<0.05)；马氏珠母贝Kelch-like基因共有56个SNP位点，其中，31个SNP位点为中度多态，其余位点为低度多态；10个SNP位点形成了1个单倍块，为4种单倍型，其中单倍型AATCTGTCGG为优异单倍型，其壳质量性状显著大于单倍型AGCCTACCGA和单倍型AGCCTACTTA(P<0.05)。研究表明，马氏珠母贝Kelch-like可能参与贝壳棱柱层的形成，其单倍型AATCTGTCGG具有作为以壳质量为目标的育种标记的潜力，该结果对于选育具有优良经济性状的马氏珠母贝具有重要意义。

关键词：马氏珠母贝,Kelch-like基因,序列分析,表达模式

基金资助：广东省基础与应用基础研究基金项目(2019A1515111026)；大学生创新创业训练计划项目(CXXL2020045)；广东省教育厅科研项目(2019KQNCX043，2020ZDZX1045)；广东省农业农村厅项目(2020KJ146和粤财农[2020]4号)