《大连海洋大学学报杂志》发表论文赏析

波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析

来源:大连海洋大学学报杂志2022年第5期北京时间:

作者:梁妃爽, 梁华芳, 卓宏标, 孙榕泽, 王潘妹, 温崇庆

单位:广东海洋大学 水产学院,广东 湛江 524088

摘要:为了探究波纹龙虾Panulirushomarus对亚硝酸盐的胁迫响应机理,采用转录组学测序分析方法,进行了正常养殖条件下波纹龙虾(体质量为39.00 g±5.31 g)肝胰腺和质量浓度为80 mg/L亚硝酸盐胁迫7 d的肝胰腺转录组比较研究。结果表明:转录组共筛选得到264 个差异表达基因,其中,86 个基因上调表达, 178 个基因下调表达;GO功能注释显示,被注释的差异表达基因主要与结合、催化和代谢等功能有关;KEGG 通路富集分析显示,差异表达基因在黏着斑、白细胞跨内皮层迁移、胰岛素抵抗、紧密连接、淀粉与蔗糖代谢等通路中显著富集;随机挑选9个差异表达基因进行qRT-PCR验证,发现荧光定量结果与测序结果基本一致。研究表明,在亚硝酸盐胁迫下,通过GO和KEGG分析发现差异表达基因主要富集在能量代谢、生长和免疫等通路中,挖掘出的数据可为后续研究提供科学参考。

关键词:波纹龙虾,亚硝酸盐胁迫,转录组,差异表达基因

基金资助:广东省科技厅农业攻关项目(2013B020308009);广东海洋大学科研项目(C16394)

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