马氏珠母贝TTLL基因的序列特征、SNP筛选及其与生长性状的关联分析

来源：大连海洋大学学报杂志2022年第6期北京时间：

作者：尹诗欣, 李志屿, 杨晶淼, 廖永山, 杨创业, 邓岳文, 王庆恒

单位：1.广东海洋大学 水产学院，广东 湛江 524088；2.广东海洋大学 珍珠研究所，广东 湛江 524088；3.广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心，广东 湛江 524088

摘要：为了探究微管蛋白酪氨酸连接酶样(tubulin tyrosine ligase-like,TTLL)在马氏珠母贝Pinctadafucatamartensii中的作用，对TTLL基因的序列特征、表达模式及其SNP位点进行了相关分析。结果表明：采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝TTLL基因cDNA全长为1 962 bp，其中，开放阅读框(ORF)为1 611 bp，编码536个氨基酸，5′UTR长134 bp，3′UTR长191 bp；TTLL蛋白靠近N端处具有一个TTL结构域；多序列比对及系统进化树分析显示，马氏珠母贝与其他物种的TTLL氨基酸序列具有较高的同源性，并与长牡蛎Crassostreagigas等双壳贝类聚为一支；qRT-PCR分析显示，TTLL基因在马氏珠母贝外套膜、闭壳肌、性腺、肝胰腺、鳃和足中均有表达，在性腺中表达量最高(PG和g.7572368 A>G与壳宽显著性关联(PT与壳长、壳高显著性关联(P0.05)。研究表明，TTLL基因参与马氏珠母贝的生长发育过程，且其优异单倍型GG及突变位点g.7572350 T>G、g.7572368 A>G和g.7572405 C>T均有利于马氏珠母贝的生长。

关键词：马氏珠母贝,微管蛋白酪氨酸连接酶样(TTLL),序列特征,表达模式,SNPs,生长性状

基金资助：广东省教育厅科研项目(2020ZDZX1045)；北海市科技计划项目(2020165010)；广东省农业农村厅科研项目(粤财农[2020]4号)