基于高通量测序的野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落多样性分析

来源：大连海洋大学学报杂志2022年第6期北京时间：

作者：许竟成, 林衍峰, 杨泉, 沈冰燕, 耿洪璐, 李梅, 李婷婷, 杨奥伟, 柏晓辉

单位：1.黄山学院 生命与环境科学学院，安徽 黄山 245041；2.休宁县水产站，安徽 休宁 245400

摘要：为探究野生和养殖台湾白甲鱼OnychostomabarbatulumPellegrin皮肤细菌菌群组成及其多样性，采用16S rRNA基因V3～V4区高通量测序法，对1龄野生及养殖的健康台湾白甲鱼皮肤细菌进行测序及信息学分析。结果表明：台湾白甲鱼皮肤细菌菌群主要分布在18个门，其中，变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes和放线菌门Actinobacteria的菌落数最多；从属水平分析，菌落含量丰富度排名前8的菌主要分布在嗜氢菌属Hydrogenophilus、变形杆菌属Proteus、芽孢杆菌属Bacillus、水栖菌属Enhydrobacter、普雷沃菌属Prevotella、刺骨鱼菌属Epulopiscium、纤维弧菌属Cellvibrio和雷尔氏菌属Ralstonia；细菌群落功能分析显示，这些菌群主要参与氨基酸代谢、碳水化合物代谢、辅因子与维生素代谢、脂代谢、次级代谢产物合成和能量代谢；通过比较野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落发现，厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、疣微菌门和酸杆菌门是台湾白甲鱼中广泛存在的菌群。研究表明，野生和养殖台湾白甲鱼皮肤的细菌群落组成及多样性存在明显差异，野生台湾白甲鱼皮肤的细菌菌群远多于养殖台湾白甲鱼。

关键词：台湾白甲鱼,皮肤细菌,高通量测序,细菌群落组成

基金资助：安徽省高校自然科学基金重点项目(KJ2019A0612，KJ2019A0611)；安徽省自然科学基金(1908085QC124)；省级大学生创新创业项目(S202010375018，S202010375025，S202010375010)；安徽省高校优秀拔尖人才培育项目(gxgwfx2020060)；黄山学院科研平台及创新团队(kypt202101，2021XCXTD03)