马氏珠母贝α-Tubulin基因结构、SNP筛选及耐低温相关性分析

来源：大连海洋大学学报杂志2023年第3期北京时间：

作者：刘雅, 李松谕, 赖卓欣, 钟如卓, 王庆恒, 邓岳文

单位：1.湛江中心人民医院 湛江市临床医学研究所，广东 湛江 524000；2.广东海洋大学 水产学院，广东 湛江 524088；3.广东省珍珠科技创新中心，广东 湛江 524088

摘要：为了探究马氏珠母贝(Pinctadafucatamartensii)α-Tubulin基因在低温适应性中的作用，通过RACE克隆技术获得马氏珠母贝α-Tubulin基因，分析了α-Tubulin基因在低温胁迫下的表达趋势，并筛选和比较了马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的α-Tubulin编码区SNP位点。结果表明：马氏珠母贝α-Tubulin基因总长为2 107 bp，可编码454个氨基酸，具有典型的Tubulin和Tubulin-C结构域；全组织定量显示，α-Tubulin基因在所有组织中均有表达，在足部中表达量最高(P<0.05)；低温胁迫时，鳃组织中α-Tubulin基因在低温组(12、17 ℃)的表达量均在72 h时达到最高，且显著高于对照组(22 ℃)(P<0.05)；α-Tubulin外显子区域共有34个SNP，其中3个SNP位点的基因型频率在R和W群体间有显著性差异(P<0.05)；连锁不平衡分析显示，R群体单倍型CCTCAGCGCC的频率明显高于W群体。研究表明，α-Tubulin为参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因，筛选出的与抗低温性状相关的SNP位点g.111071125及优异单倍型CCTCAGCGCC，可作为选择育种的候选标记。

关键词：马氏珠母贝,α-Tubulin基因,SNP,低温耐受

基金资助：广东省教育厅重点领域专项(2020ZDZX1045)；广东省自然科学基金(2020A151501691)；广东省现代农业产业技术体系-贝藻类产业创新团队(KJ146)