大竹蛏水管自切后再生过程的转录组学分析

来源：大连海洋大学学报杂志2023年第4期北京时间：

作者：孙雪峰, 陈爱华, 张志东, 陈素华, 张雨, 曹奕, 朱艳青, 杨家新, 蒋建斌, 吴杨平

单位：1.南京师范大学 海洋科学与工程学院，江苏 南京 210023；2.江苏省海洋水产研究所 江苏省文蛤良种场，江苏 南通 226007；3.南通市通州区水产技术指导站，江苏 南通 226300

摘要：为探究大竹蛏(Solengrandis)水管自切后再生期间的转录组变化情况，通过二代测序技术分别对大竹蛏(壳长为8～10 cm)水管自切前(对照组)和自切后7 h、7 d、20 d(选择组)进行转录组学分析。结果表明：原始数据经拼接注释后共获得103 909条Unigenes，其中，30 027条Unigenes得到注释，注释率为28.90%；差异基因GO功能注释显示，自切后7 h时钙离子结合条目富集程度最高且富集基因数最多，自切后7 d和20 d时几丁质结合条目富集程度最高；KEGG通路富集分析显示，仅自切后7 d时具有显著富集通路，包括氨基糖与核苷酸糖代谢、氮素代谢、黏着斑、溶酶体和MAPK信号通路；差异基因时间趋势分析显示，富集基因数前3的模式依次为Profile5、Profile17和Profile12，各模式表达基因GO功能注释结果显示，Profile5中有529条基因显著富集到离子结合条目，占比为53.77%，Profile17和Profile12中显著富集基因数最多的条目分别为受体活性和几丁质代谢；随机挑选 6个差异基因进行RT-qPCR 验证，结果证明转录组测序结果可靠。初步推测，在水管再生早期(自切后7 h)，以钙离子为代表的信号分子在传递受损信号过程中发挥重要作用，同时多种受体活性增强响应水管再生过程，随着再生的进行，物质代谢和生物合成过程大量增加以满足组织再生的需求。

关键词：大竹蛏,水管再生,转录组,高通量测序

基金资助：江苏省农业重大技术协同推广项目(2020-SJ-047-07)；南通市基础科学研究项目(JC2021012，JC2020117)