须鳗虾虎鱼线粒体全基因组测序和系统发育分析

来源：大连海洋大学学报杂志2023年第5期北京时间：

作者：梁阳阳, 张国庆, 陈诚, 赵秀侠, 高娜, 李静, 方婷, 杨坤, 尹峰, 郭伟, 卢文轩

单位：1.安徽省农业科学院水产研究所 水产增养殖安徽省重点实验室，安徽 合肥 230001；2.巢湖管理局渔政管理总站，安徽 合肥 238001

摘要：为了解须鳗虾虎鱼(Taenioidescirratus)线粒体基因组特征和系统发育状况，采用Illumina Hiseq高通量测序技术，测定了从南渡江口、珠江口、太湖、巢湖和南四湖中采集的12尾须鳗虾虎鱼的线粒体全基因组，并下载近缘种线粒体全基因组序列进行系统发育分析。结果表明：须鳗虾虎鱼线粒体全基因组长为16 641～16 978 bp，包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个D-loop控制区，各样本的编码基因序列长度较一致，线粒体全基因组长度差异主要是由控制区长度(975～1 314 bp)差异造成的；基于13个蛋白编码基因和2个rRNA 基因序列构建系统发育树，须鳗虾虎鱼分为3个高支持率进化枝，与红狼牙虾虎鱼(Odontamblyopusrubicundus)、鲡形鳗虾虎鱼(Taenioidesanguillaris)形成并系，太湖、巢湖和南四湖的须鳗虾虎鱼个体聚为1个进化枝，南渡江口和珠江口的须鳗虾虎鱼个体均分属2个进化枝。研究表明，青藏高原隆起和亚洲季风形成带来的中国水系格局变化，可能是须鳗虾虎鱼形成目前系统发育结构的重要原因，本研究结果可为进一步明确须鳗虾虎鱼的分类地位和资源保护提供重要依据。

关键词：须鳗虾虎鱼,线粒体基因组,系统发育

基金资助：安徽省自然科学基金(2008085QC105)；财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系资助(CARS-46)；安徽省水产产业技术体系(皖农科函[2021]711号)；安徽省农业科学院湿地生态与应用技术创新团队项目(2021YL055)