《大连海洋大学学报杂志》发表论文赏析

单环刺螠响应双酚A胁迫的转录组分析

来源:大连海洋大学学报杂志2023年第5期北京时间:

作者:许星鸿, 丁子媛, 张馨予, 刘顺, 亓鲁, 王思婕, 朱大千

单位:江苏海洋大学 海洋科学与水产学院,江苏 连云港 222005

摘要:为探究环境内分泌干扰物双酚A(bisphenol A,BPA)对海洋底栖动物单环刺螠(Urechisunicinctus)毒性影响的分子机制,采用高通量测序平台Illumina Hiseq 2500分别对BPA暴露后和对照组单环刺螠(体质量为17.3 g±1.5 g)的体腔细胞转录组进行测序及比较分析。结果表明:高通量测序共获得13.74 Gb高质量数据,组装得到108 262个转录本和30 882条单基因序列(Unigene),平均长度为1 380 bp,N50长度为2 549 bp;共有14 581个Unigene得到注释,其中7 242个Unigene注释到KEGG数据库,归类于284个代谢通路;BPA胁迫下筛选出1 073个差异表达基因,包括649个基因表达上调和424个基因表达下调;GO功能分类注释显示,差异基因主要涉及催化、结合、抗氧化、转运体、信号转导和电子载体等分子功能;KEGG富集分析显示,163个基因被注释到151条KEGG通路中,富集程度最显著的3个通路为真核生物核糖体生物合成、谷胱甘肽代谢和细胞色素P450对外源物质代谢。研究表明,BPA胁迫会对单环刺螠体腔细胞的合成、免疫及解毒代谢产生显著影响,获得的单环刺螠体腔细胞转录组数据可为揭示单环刺螠的抗逆机制,以及研究环境内分泌干扰物对海洋生物的毒性提供参考依据。

关键词:单环刺螠,体腔细胞,BPA胁迫,转录组,差异表达基因

基金资助:江苏省科技厅苏北科技专项(SZ-LYG202124,LYG-SZ201814);连云港市“花果山英才计划“(KK20100);连云港市科技局现代农业项目(CN1411);江苏省研究生和大学生科研与实践创新计划项目(KYCX2021-033,2022205)

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