尼罗罗非鱼MYF5基因SNP位点筛选及其与不同群体生长性状的关联分析

来源：大连海洋大学学报杂志2023年第6期北京时间：

作者：佟延南, 高风英, 刘志刚, 王淼, 曹建萌, 衣萌萌, 可小丽, 卢迈新, 朱海

单位：1.海南省海洋与渔业科学院，海南 海口 570206；2.中国水产科学研究院珠江水产研究所 农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东 广州 510380

摘要：为探寻肌源性调节因子5基因(MYF5)的单核苷酸多态性(SNP)标记与尼罗罗非鱼(Oerochromisniloticus)生长性状的相关性，采用PCR和测序法筛查SNP，并通过测序方法确认，从筛查到的35个SNP位点中挑选多态性较好的30个位点在尼罗罗非鱼高要亲代群体中进行分型分析，并与生长性状进行关联分析，将获得的生长相关位点在高要子代群体、番禺群体及海南群体中进行验证。结果表明：高要亲代群体中S18(G-1739C)位点与体质量、体宽显著相关(P<0.05)，S3(A-113G)和S4(C-170T)位点与全长显著相关(P<0.05)，S5(C-323T)和S24(C-2345T)位点与头长显著相关(P<0.05)；高要子代群体中，S3、S4位点与体质量显著相关(P<0.05)，S24位点与体长、体高显著相关(P<0.05)；在番禺群体中获得的与体质量显著相关的SNP位点分别为S7(A-626T)、S21(C-2090G)和S32(G-2759T)，与全长显著相关的SNP位点为S7；海南群体中未获得与生长性状显著相关的SNP位点；双倍型与各群体生长性状关联分析表明，在高要亲代群体中获得与全长、头长、体高显著相关的双倍型各1个，在高要子代群体中获得与体质量显著相关的双倍型1个，在番禺群体及海南群体中未获得与生长性状相关的双倍型。研究表明，从高要群体MYF5基因上获得的S3、S4和S18 3个SNP 位点可能影响尼罗罗非鱼的生长性状或与之紧密连锁，这些位点可以作为候选基因标记，用于尼罗罗非鱼生长相关分子标记辅助育种研究。

关键词：尼罗罗非鱼,肌源性调节因子5,单核苷酸多态性,双倍型,生长性状

基金资助：海南省重点研发计划项目(ZDYF2020096)；财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系资助(CARS-46)；2022 年省级乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-SPY-00-005)；广东省重点领域研发计划项目(2021B0202020001)