《大连海洋大学学报杂志》发表论文赏析

皱纹盘鲍摄食不同藻类的转录组响应及相关硫酸酯酶基因ids-1功能分析

来源:大连海洋大学学报杂志2024年第6期北京时间:

作者:胡涛泽, 谢玉素, 李超, 姚奕冰, 刘晓, 许飞

单位:1.浙江海洋大学 水产学院,浙江 舟山 316022;2.中国科学院海洋研究所,水产品种创制与高效养殖重点实验室,山东 青岛 266071

摘要:为解析皱纹盘鲍(Haliotisdiscushannai)对其摄食藻类的分解与适应机制,采用转录组测序、生物信息学分析、基因克隆、荧光定量PCR、原核表达、蛋白纯化及酶活检测等方法,进行了3种藻类[海带(Laminariajaponica)、龙须菜(Gracilarialemaneiformis)和孔石莼(Ulvapertusa)]喂养条件下内脏团组织差异表达基因的研究,进一步选取饵料适应相关的硫酸酯酶ids-1基因,进行了基因克隆和初步的功能分析。结果表明:在龙须菜和海带对比组(Long vs Hai)中共鉴定到上调差异基因104 个,下调差异基因118 个;孔石莼和海带对比组(Shi vs Hai)中筛选出上调基因 80 个,下调基因93 个;孔石莼和龙须菜对比组(Shi vs Long)中,上调基因与下调基因个数分别为 77 、 72 个;富集分析结果显示,差异基因富集到的条目多与物质代谢,尤其是硫酸化物质的合成、分解及代谢有关,其中在GO:0006027(glycosaminoglycan catabolic process)鉴定到多个出现表达差异的硫酸酯酶基因;克隆了皱纹盘鲍硫酸酯酶ids-1基因,其开放阅读框为1 767 bp,可编码588个氨基酸,包含N端信号肽结构(1~23 aa)、硫酸酯酶的保守结构域(28~376 aa)及9个糖基化位点;系统发育分析表明,皱纹盘鲍IDS-1与红鲍及黑唇鲍IDS的同源性最高;氨基酸序列比对结果显示,皱纹盘鲍IDS-1既具有硫酸酯酶家族典型的五肽基序“CXPXR”,也含有IDS亚家族高度保守的活性位点;然而,利用大肠杆菌体外表达系统获得的IDS-1重组蛋白并未显示硫酸酯酶的活性;qPCR结果显示,ids-1在皱纹盘鲍消化腺中表达量最高,其次为鳃和外套膜,上足触手组织表达量较低;ids-1的表达还具有发育阶段特异性,在受精卵至浮游幼虫阶段表达量低,自匍匐幼虫开始升高,至成体时表达水平最高;在不同藻类喂养条件下的ids-1表达差异显著,海带喂养组表达量显著高于龙须菜和孔石莼喂养组,孔石莼组表达量最低。研究表明,ids-1与鲍个体发育过程中的营养模式及食性转换密切相关,其表达量可能受到摄食偏好性及摄食量差异的直接影响,本研究为深入解析皱纹盘鲍的饵料适应调控机制提供了参考。

关键词:皱纹盘鲍,转录组学,硫酸酯酶,IDS,分子特征,饵料适应

基金资助:山东省农业良种工程(2022LZGC015);泰山学者青年专家项目(tsqn202211250)

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