长吻鮠5个养殖群体遗传多样性的微卫星分析

来源：大连海洋大学学报杂志2025年第4期北京时间：

作者：于爱清, 施永海, 徐嘉波, 刘永士, 蒋飞, 袁新程

单位：上海市水产研究所，上海市水产技术推广站，上海 200433

摘要：为研究长吻鮠(Leiocassislongirostris)不同养殖群体的遗传多样性和遗传结构差异，以制定科学有效的长吻鮠良种选育策略，采用20对荧光标记EST-SSR引物对上海宝山群体(BS)、江苏常州群体(CZ)、四川眉山群体(MS)、广东顺德群体(SD)和湖北仙桃群体(XT)5个长吻鮠养殖群体的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果表明，20对EST-SSR引物共获得了219个等位基因，平均每对引物获得10.95个等位基因；5个长吻鮠养殖群体的平均有效等位基因数(Ne)、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别为3.03～4.13、0.708 3～0.813 3、0.624 3～0.727 6和0.574 0～0.686 5；哈迪-温伯格平衡检测结果显示，在所分析的100个群体位点组合中，有45%的群体位点组合显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.05)；群体遗传分化分析的结果显示，长吻鮠BS与MS、SD和XT群体具有中等程度的遗传分化(0.05<Fst<0.15)，其他两两群体间的遗传分化微弱(Fst<0.05)；分子方差分析(AMOVA)结果显示，大部分的遗传变异来源于群体内个体间的遗传差异(95.28%)，仅有4.72%的遗传变异来源于群体间；UPGMA聚类分析、PCoA分析和贝叶斯Structure聚类分析的结果均一致地揭示了5个长吻鮠养殖群体的两大分类，其中，宝山群体(BS)单独构成一个类群，而CZ、MS、SD和XT群体则聚为另一大类。研究表明，5个长吻鮠养殖群体均具有相对较高的遗传多样性水平，并呈现出不同程度的遗传结构差异，特别是宝山群体(BS)具有相对独立的遗传结构特征。

关键词：长吻鮠,养殖群体,微卫星标记,遗传多样性,遗传分化

基金资助：上海市科技创新行动计划[22N11900600]；上海市领军人才(沪人社专2021-67号)；上海市长江口主要经济水生动物人工繁育工程技术研究中心(13DZ2251800)