《大连海洋大学学报杂志》发表论文赏析
作者:崔晓玉, 喻景华, 闫启仑, 张金勇, 刘述锡, 李宏俊, 郭皓
单位:1.国家海洋环境监测中心 国家环境保护近岸海域生态环境重点实验室,辽宁 大连 116023;2.大连海洋大学 海洋科技与环境学院,辽宁 大连 116023
摘要:为了更全面地评估大连普兰店湾浮游动物多样性,推动DNA宏条形码技术在海洋生物监测中的应用,采用基于16S、18S V4和18S V9三对引物的DNA宏条形码技术,系统分析了该海域浮游动物的种类组成、多样性及其与环境因子的关系。结果表明:16S引物所有站位样品总共获得72个OTUs;18S V4区引物所有站位样品总共获得77个OTUs;18S V9区引物所有站位样品总共获得470个OTUs;其中16S检测出6门10纲20目37科,18S V4检测出9门20纲37目52科,18S V9检测出34门79纲158目222科;基于16S、18S V4和18S V9区引物检出的浮游动物群落结构中节肢动物门占比均为最高,按所占比例呈现出18S V9(83.12%)>18S V4(78.1%)>16S(74.28%)的变化规律;基于18S V9区引物检出的浮游动物的Ace、Chao1和Shannon指数均显著高于16S和18S V4,门、纲、目和科的reads数和OTUs最高;冗余分析表明,水深和溶解氧是影响16S、18S V4和18S V9区引物所检出的浮游动物群落结构的主要环境因子。研究表明,通过对比不同宏条形码引物检出的大连普兰店湾浮游动物的群落结构及丰度特征,丰富了对普兰店湾浮游动物的认识,为DNA宏条形码技术在海洋生物多样性业务化监测中的推广与应用提供了科学依据。
关键词:浮游动物多样性,DNA宏条形码,高通量测序,物种组成,16S,18SV4,18SV9
基金资助:国家自然科学基金(42206128);国家海洋环境监测中心博士科研启动经费项目(2020-A-06);农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室开放基金课题(FREU2020-03)